Jan Hanzelka is een onderzoeker in de populatie-ecologie van vogels. Zijn belangrijkste onderzoeksinteresses omvatten het onderzoeken van de effecten van milieufactoren op vogelpopulaties, met name de effecten van klimaat- en habitatveranderingen op vogels op grote ruimtelijke schaal. In het kader van HABITRACK is hij verantwoordelijk voor de ontwikkeling van een analytische workflow voor de analyse van de effecten van milieuoverdracht op de broedprestaties van vogels.