Anne-Christine Monnet’s onderzoek richt zich op de ruimtelijke dynamiek van planten- en dierpopulaties en hun impact op soortbehoud. Ze is de projectleider van HABITRACK en verantwoordelijk voor de animatie van het onderzoeksconsortium, de verspreiding van de resultaten en de modellering van habitatbehoeften, broedstatus en prestaties van vogels.