Anne-Christine Monnets Forschung konzentriert sich auf die räumliche Dynamik von Pflanzen- und Tierpopulationen und deren Auswirkungen auf den Artenschutz. Sie ist die Projektleiterin von HABITRACK und verantwortlich für die Motivation des Forschungskonsortiums, die Verbreitung der Ergebnisse und die Modellierung von Habitatbedürfnissen, des Brutstatus und der Leistung von Vögeln.