Evropská populace vodouše tmavého se odhaduje na 20 000-45 000 párů, které zimují hlavně na pobřeží Středozemního moře a v oblasti Sahelu (Delany et al. 2009). Tento druh hnízdí v tundře a v otevřených mokřadních habitatech v tajze. V nejjižnější části hnízdního areálu využívá k hnízdění i mozaikovitou zemědělskou krajinu (Keller et al., 2020). Hnízdní početnost druhu zůstává ve Skandinávii nízká a dynamika početnosti vykazuje negativní trendy jak v krátkodobém, tak v dlouhodobém horizontu (Lindström et al. 2015). Jedním z důvodů úbytku druhu může být nadměrné odvodňování rašelinišť ve Finsku (Fraixedas et al. 2017). Tento druh je jedním z nejméně studovaných evropských bahňáků a dosud nebyl telemetricky sledován.